SourceTreeでコミット間の差分ファイルを抽出しよう (カスタム操作を使う方法) - ICS MEDIA

https://ics.media/entry/4475

Windows版Sourcetreeの「内臓Git」だと動作しなくて、Gitの公式サイトから最新版をダウンロードしインストール後、
「システムGitを使用」にしたら動きました。

たぶん以下のサイト説明のように、Gitをコマンドラインから利用「Use Git from the Windows Command Prompt」にしないと動作しないと思います。

コマンドラインからGitを使う（for Windows） - Qiita